Прошло два с небольшим года с тех пор, как бойцы распрощались с бакуганами. Ребята уже почти забыли про игру Бакуган, как внезапно бакуган Дэна, Драго просит того о помощи. Вместе с Маручо, Дэн отправляется в Новую Вестрою. Планету, на которой жили бакуганы, захватили Вексы — могущественные люди с планеты Вестал. Обычный народ Вестала — весты, мирные жители. Но Вексы — это корпорация из шести бойцов-вестов, мастеров всех стихий бакуган (как когда-то и на Землю, на Вестал тоже посыпались карты с неба).

Имена Вексов:
Гас Грав, стихия — Сабтерра;
Волт Ластер, стихия — Хаос;
Шедоу Проув, стихия — Даркус;
Майлин Фероу, стихия — Аквос;
Линк Волан, стихия — Вентус;
Спектра Фантом, стихия — Пайрус.

Когда Дэн и Маручо попали в Новую Вестрою, они познакомились с Фронтом Сопротивления бакуган — его предводительницей Мирой Фермен (Клэй), Эйсом Гритом и Бэроном Лэтлоем. Вскоре к ним присоединяется и Шун. Как выясняется Спектра — предводитель Вексов — брат Миры (также известный как Кит Фермен). Королевская семья — изгнанный король Вестала Зеногелд и его сын, принц Хайдрон, смещают Спектру с престола, и тот вместе со своим преданным помощником Гасом начинает мстить Зеногелду .